통합 필터가 있는 분쇄 백을 사용하는 주요 이점은 초기 균질화 단계에서 물리적 이물질을 효율적으로 제거하는 것입니다. 벌 사체 및 키틴질 외골격과 같은 거친 입자 물질을 액체 샘플에서 분리함으로써 이러한 백은 훨씬 더 깨끗한 용해물을 생성합니다. 이 예비 여과 단계는 후속 DNA 추출 공정에서 기계적 문제를 방지하는 데 중요합니다.
통합 필터 백은 DNA가 풍부한 유체에서 고체 불순물을 분리하는 과정을 자동화하여 원심 분리 및 정제 단계에서 막힘을 방지하는 역할을 합니다.
샘플 선명도 최적화
거친 입자 유지
꿀벌 샘플에서 DNA를 추출하려면 단단한 생물학적 물질을 분해해야 합니다. 통합 필터가 있는 분쇄 백은 큰 고체 불순물을 물리적으로 유지하도록 설계되었습니다.
이는 벌 사체와 키틴질 외골격 조각을 백 안에 효과적으로 가둡니다. 이 이물질을 가두어 추출에 사용될 액상과 섞이지 않도록 합니다.
더 깨끗한 용해물 생산
필터에 의해 고체 덩어리가 걸러지기 때문에 통과하는 액체는 일반적인 균질물보다 훨씬 더 깨끗합니다.
이 액체에는 표적 DNA가 포함되어 있지만 곤충을 으깬 결과로 일반적으로 발생하는 무거운 침전물은 없습니다. 이 분리는 분쇄 공정과 동시에 발생하며 추가적인 수동 단계가 필요하지 않습니다.
후속 워크플로우 보호
컬럼 막힘 방지
많은 DNA 추출 프로토콜은 막힘에 민감한 스핀 컬럼 또는 여과막을 사용합니다.
이러한 백에서 얻은 사전 여과된 액체는 이러한 컬럼에 도입되는 입자 부하를 크게 줄입니다. 이는 샘플을 망치거나 공정을 중단시킬 수 있는 기공 막힘의 위험을 최소화합니다.
원심 분리 성능 향상
샘플에 이물질이 많이 포함되어 있으면 원심 분리가 고체를 효과적으로 펠릿화하지 못하거나 깨끗하게 흡입하기 어려운 상등액이 생성될 수 있습니다.
필터 백을 사용하면 원심 분기에 들어가는 액체가 이미 거시적 입자가 거의 없는 상태임을 보장합니다. 이는 더 깨끗한 분리를 유도하고 액체 취급 중 오염 물질 전달 가능성을 줄입니다.
절충점 이해
비용 대비 처리량
통합 필터가 있는 백은 일반적으로 표준 비필터 분쇄 백보다 비쌉니다.
그러나 대량 처리의 경우 막힌 컬럼과 재추출을 피하는 데 드는 시간 절약으로 인해 이 비용이 상쇄되는 경우가 많습니다. 매우 작고 예산이 적은 실험의 경우 추가 비용에 대한 정당성이 필요할 수 있습니다.
액체 보유
필터 막과 유지된 이물질은 소량의 용해 완충액을 물리적으로 보유할 수 있습니다.
후속 단계를 위해 충분한 액체를 회수하려면 초기 완충액 양이 이 약간의 손실을 고려할 만큼 충분한지 확인하는 것이 중요합니다.
목표에 맞는 올바른 선택
필터 백이 노제마 추출 워크플로우에 필요한지 여부를 결정하려면 특정 제약 조건을 고려하십시오.
- 처리 속도와 안정성이 주요 초점인 경우: 통합 필터 백을 사용하여 고처리량 워크플로우에서 막힘 및 중단 위험을 최소화하십시오.
- 소모품 비용 최소화가 주요 초점인 경우: 표준 백을 선택할 수 있지만 이물질 전달을 피하기 위해 더 신중한 수동 피펫팅을 준비하십시오.
필터 분쇄 백을 배포하는 것은 본질적으로 소모품 비용의 약간의 증가를 공정 안정성과 샘플 순도의 상당한 증가와 교환하는 것입니다.
요약 표:
| 특징 | 노제마 추출 이점 | 워크플로우에 미치는 영향 |
|---|---|---|
| 통합 여과 | 키틴질 외골격 및 벌 사체 제거 | 스핀 컬럼의 기계적 막힘 방지 |
| 자동 분리 | 동시 분쇄 및 이물질 유지 | 수동 여과 단계 제거, 시간 절약 |
| 용해물 선명도 향상 | 무거운 침전물이 없는 액상 생성 | 원심 분리 효율 및 펠릿화 향상 |
| 공정 안정성 | 민감한 막의 입자 부하 감소 | 샘플 손실 및 재추출률 최소화 |
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참고문헌
- Ingemar Fries, Geoffrey R. Williams. Standard methods for<i>Nosema</i>research. DOI: 10.3896/ibra.1.52.1.14
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